Se realizó un estudio en los ríos Escárrea y Gariché del distrito de Bugaba, provincia de Chiriqui, donde se realizaron dos muestreos para cada una de las estaciones (seca y lluviosa) para ambos ríos, se consideraron las cuecas alta, media y baja. Levando a cabo un total de 24 muestreos. Los resultados fueron los siguientes: las diatomeas más abundantes en el rio Gariché para la estación seca se identificaron fueron: Staurosira sp., Fragilaria frankophila, Fragilaria ulna, Ropalodia rupestris y para la estación Iluviosa: Frustulia romboides, Melosira cf. varians, Staurosira sp., Geissleria schoenfeldi y Nitzschia paleaeformis. Las diatomeas más abundantes en el rio Escárrea para la estación seca fueron: Cocconeis placentula var. Euglypta, Ropalodia gibberula, Cymbella turgidula, Fragilaria goulardii y Fragilaria ulna: y para la estación Iluviosa: Nupela praesipua, Geissleria schoenfeldi, Cymbella turgidula, Gomphonema parvulum, Navicula erifuga y Nitzschia palea. El Índice de Shannon Wienner con mayor valor para el rio Gariché fue 3.02 y el valor más bajo 2.26; y el indice de Shannon Wienner con mayor valor para el rio Escárrea fue 3.75 y el valor más bajo fue 2.12. Se dio el índice mas alto en la estación lluviosa y el más bajo e la estación seca para ambos rios. El indice diatomológico general (IDG) para la estación seca se obtuvo el valor más alto en el rio Escárrea con 4.28 y el valor más bajo se obtuvo para la estación Lluviosa e el rio Gariché con 2.66. Las especies de diatomeas mencionadas anteriormente son consideradas como especies bioindicadores lo que indicó una posible variable de la calidad de las aguas e ambos ríos en estudios. Además de la ganadería, la agricultura y las actividades antropogénicas es posible que afecten a la población de las diatomeas y a medida que se siga incidiendo en estos factores ambientales en la calidad de agua de los ríos Escárrea y Gariché.